115例新型冠状病毒感染儿童的临床特点分析、武汉同济医院医务人员2019新型冠状病毒感染相关因素的病例对照研究、洛匹那韦/利托那韦对新型冠状病毒肺炎患者血脂水平的影响……3月26日，记者从中国药科大学获悉，该校基础医学与临床药学学院2018级药理学专业博士生孙庆荣带领团队成功开发出一个冠状病毒资源数据库。该数据库平台整合了1.2万余篇中外有关冠状病毒的相关文献资料索引信息、病毒相关数据以及病毒研究相关分析工具，相关文献跨越50多年的研究，团队历时32天攻关完成。
收录50余年来的冠状病毒相关文献信息
打开冠状病毒资源数据库网站，有关冠状病毒研究的文献、专利、数据资源一目了然。中国药科大学基础医学与临床药学学院2018级药理学专业博士生孙庆荣介绍，数据库中的研究报告和综述性论文，从1965年跨越至2020年，可以方便广大学者便捷、迅速地查找包括新冠病毒在内的冠状病毒的相关研究文献，深入了解冠状病毒的起源、研究历史、研究进程、研究热点等，促进药学、化学、生物学等多学科的交叉融合。
“这些海量的文献研究资料，数据库没有照单全收，我们剔除了一些评论性以及策略性文章，只保留了学术研究、学术综述、病例解析、数据平台、分析工具等内容，以更好地集中有效学术资源。”孙庆荣说，冠状病毒资源数据库从建立到完善仅仅才32天，截至3月22日，数据库里共收集了9556篇英文研究文献、3052篇中文研究文献的索引信息，25个英文数据资源平台、6个中文数据资源平台以及18个与病毒学相关的主要分析工具等等。
为何开发创建冠状病毒资源数据库？孙庆荣坦言，这一开发灵感主要来源于导师、中国药科大学校长来茂德。疫情发生后，来茂德从医药大数据的角度鼓励学生们多进行新冠病毒的相关研究，包括基础的多序列比对、进化分析以及新冠病毒重要靶点ACE2蛋白的分析等。
将持续更新数据库资源
说干就干，孙庆荣迅速与中国药科大学药学、临床药学、中药学、生物制药等多个专业的11位志同道合的本科生组建团队，大家一起查阅文献、整理资料、搭建网站……
孙庆荣坦言，冠状病毒资源数据库的建立，一波三折。数据库服务器基础环境的构建、数据整合、信息展示等环节，都曾遇到过各种各样的困难。
“数据库服务器基础环境建设需要相关专业人员才能实现，数据的整合需要人工检索、筛选，工作量巨大。还有一些图书馆资源的问题，也需要专业人士的帮助。除此之外，疫情期间均需要各自居家工作，由于团队成员家庭网络的差异，大家的网络最优时段也不同，协调统一会有点难度。”孙庆荣说。
不过，办法总比困难多，面对诸多难题。国内资源数量相对少，他们就采用人工检索为主的方式逐一搜索中国知网和万方数据库的文献；对于国外资源，他们采用API和人工检索相结合的方法，实现数据的整合及入库。
研发期间，数据库还得到该校图书与信息中心老师们的指导、支持。“团队的建立、基础环境构建、数据库的测试，若是没有老师们的帮助，根本完不成。”
孙庆荣说，未来，团队还将不断更新数据库资源，加入更多数据分析以及与冠状病毒相关药物的数据资源。
来源：2020年03月26日 科技日报
通讯员：姜晨、姜佳彤 记者：金凤